Mais (e maiores) referências em R!

Principal: Não esquecer o "R Book", do Crawley, com um excelente capítulo sobre análise de regressão com exemplos biológicos


Capítulo 15 de Seefeld, K. & Linder, E. Statistics Using R with Biological Examples

Regressão, o (re)começo

Material introdutório, desenvolvido pelo prof. João L. F. Batista (ESALQ/USP) como revisão/introdução (ou seja, matemática mínima necessária) a cursos de modelagem estatística em nível de graduação em engenharia florestal:

Batista, J.L.F. (2000) Análise de regressão

Regressão e anova no R:

“Practical Regression and Anova using R” by Julian Faraway (2002)

Scripts e conjuntos de dados na página do livro (Faraway, J. Linear models with R.CRC Press, 2006)

Um exemplo interessante, com dados disponíveis:
Rossiter & Loza (2009): Technical Note: Analyzing land cover change with logistic regression in R

Diversidade, ainda ...

Jogo dos 7 (ou mais) erros:
Dias, S. C. (2004): Planejando estudos de diversidade e riqueza.

Discussão interessante sobre critérios para escolha de índices de diversidade e formas "alternativas" de descrição da diversidade (perfis de diversidade, diagramas de Whittaker etc):
Melo, A. S. (2008): O que ganhamos ‘confundindo’ riqueza de espécies e equabilidade em um índice de diversidade?

Análise de diversidade com R: pacote Vegan

Apostila de bioestatística usando R:

Beasley, C. R. (2004): BIOESTATÍSTICA USANDO R (APOSTILA DE EXEMPLOS PARA O BIÓLOGO)

Material sobre o pacote Vegan:

Silva, R.R.: O Programa R na Análise Numérica em Ecologia de Comunidades

Trinca, L. A.: Comunidades Ecológicas - Um passeio pelo pacote Vegan/R

Oksanen, J. (2008): VEGAN: ECOLOGICAL DIVERSITY


Trabalhos utilizando funções do vegan:

Crema, A. (2008): Diversidade e distribuição de anfíbios anuros associados a matas de galeria dentro e fora de Unidades de Conservação do Distrito Federal.

Silva et al. (2007): Influência da estrutura da paisagem sobre a diversidade de fragmentos de floresta aluvial no Sul de Minas Gerais.

Gonçalves e Brandão (2008):Diversidade de abelhas (Hymenoptera, Apidae) ao longo de um gradiente latitudinal na Mata Atlântica.

Suárez, Y.R. (2008): Variação espacial e temporal na diversidade e composição de espécies de peixes em riachos da bacia do Rio Ivinhema, Alto Rio Paraná.

Análise de diversidade

Artigo Holos: Martins & Santos, Técnicas usuais de estimativa da biodiversidade.

Tese: Amostragem da diversidade de espécies arbóreas em florestas
tropicais: padrões e limitações de algumas medidas

aula 1: 04/08

Análise do delineamento do projeto de dissertação que está sendo desenvolvido seguindo o roteiro proposto por Feisinger (2001).

Material:

Capítulo 4 de Feisinger, P. Designing field studies for biodiversity and conservation. Island Press, New York, 2001.

Capítulo 1 de Manly, B. F. J. The design and analysis of research studies. Cambridge University Press, New York, 1992.

Quando? Onde?

Terças, 9 - 12h e 13:30-16h, sala 3008 (PG Zoo).

Datas: 04,18 e 25 de agosto; 01, 08, 15, 22 e 29 de setembro de 2009.

ementa (oficial)

Introdução às medidas de diversidade biológica; utilização de métodos de identificação de distribuição de abundância de espécies e testes de ajustes de curvas; compreensão de métodos para estimativa de número de espécies e diversidade de espécies e estudos comparativos de diversidade.

primeira ...

A disciplina CIB117 para o mestrado em Zoologia (2009-2) terá um formato "adaptativo", para tentar adequar as necessidades de cada aluno ao conteúdo que será abordado ao longo do curso. Dessa forma, esse espaço deve servir para agilizar o contato entre os integrantes da turma, promovendo a troca de idéias, sugestões e material.